单细胞揭示白血病化疗药物靶向转录因子的活

　

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导读

背景：骨髓中紧密的调节循环协调着B细胞的命运。该基因调控网路中的基因突变导致了儿童癌症的出现，如急性淋巴细胞白血病ALL。初始的基因冲击如常见的易位ETV6和RUNX1基因融合导致了细胞分化受阻。在这里，作者的目的是在B系分化轨道上确定转录因子的活性，作为描述白血病骨髓中异常细胞状态的参考，并确定那些维持癌症特异性细胞状态的转录因子，以便进行更精确的治疗干预。方法：作者使用单细胞转录组测序（scRNA-seq）和一些互补基因组图谱比较了正常B系分化和体内白血病细胞状态。基于统计工具的scRNA-seq，作者以一个工作流程为基准来解决健康骨髓淋巴细胞状态中的转录因子活性和基因表达分布变化。作者将这些与诊断时和化疗期间急性淋巴细胞白血病患者体内骨髓样品进行了比较，重点