笔记系列之网络药理1

目录

一、选题思路与基本方法

经典思路

其他思路

文章经典方法构架

（1）药物相关靶点筛选

（2）疾病相关靶点筛选

（3）取药物-疾病靶点交集并构建PPI网络

（4）对交集靶点进行通路富集分析

（5）cytoscape构建网络

（6）分子对接验证

4.另一种方法

（1）“药物PPI”与“疾病PPI”取交集

（2）筛选核心节点

（3）核心节点互作网络

（4）挖掘互作网络的module

二、TCMSP的使用

三、Uniprot数据库

DNA和蛋白质

功能1：将蛋白质名称转换为GeneSymbol

功能2：蛋白质功能查询

功能3：转换ID

（1）把基因名转化为编号

（2）把编号转化为基因名

共字62图，预计阅读需37分钟

经典思路

单药/单方/单个中药成分/中成药制剂等→某个疾病/病理过程的机制作用研究，如

《骨碎补治疗骨质疏松性骨折的网络药理学研究》

《基于网络药理学研究罗勒黄酮类活性成分在心脑血管疾病中的作用及其机制》

《川穹嗪对急性髓系白血病治疗作用的网络药理学研究》

《基于网络药理学的丹红注射液改善阿司匹林抵抗机制分析》

2.其他思路

异病同治，如《逍遥散治疗糖尿病与抑郁的异病同治研究》；

炮制对中药药效的影响，如《基于网络药理学的厚朴“发汗”科学内涵研究》；

基于数据挖掘结果分析，如《基于数据挖掘的藏药治疗HAPC高频次使用藏药网络药理学研究》；

逆向思维，如《基于网络药理学及数据挖掘探讨中药调节铁死亡的用药规律研究》；

十八反，十九畏，药物七情；

网络毒理学；

3.文章经典方法构架

以下举例文献为

[1]但文超,何庆勇,曲艺,李安琪,郭建波,丁宇坤.基于网络药理学的枳术丸调治血脂异常的分子机制研究[J].世界科学技术-中医药现代化,,21(11):-.

（1）药物相关靶点筛选

如枳术丸相关靶点筛选：

通过TCMSP（