ATAC-seq是利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序技术,全称为:AssayforTransposase-AccessibleChromatinwithhigh-throughputsequencing。其原理是Tn5转座酶携带测序接头(adaptor)随机插入并打断染色质的开放区域,打断后的染色质DNA收集在一起进行后续的建库、测序、分析可得到全基因组上的开放染色质区域信息。在此基础上再加上特有的条形码标记(barcode),便能实现scATAC-seq技术。
scATAC-seq技术目前已经成为主流的检测染色质可及性的技术,可以用比较少的细胞,在单细胞水平揭示细胞核内染色质可及性、染色质可及性在细胞间的异质性以及预测转录因子结合位点,研究转录调控网络等。ATAC-seq技术在肿瘤、免疫、发育、神经、微生物等研究领域中有着越来越广泛的应用。我们整理10xGenomics